Contact
| Email: | , |
|---|---|
| Phone: | +420 54949 6384 |
| Research group: | Computational Chemistry - Jaroslav Koča |
| Workplace: |
Publications that are part of the Web of Science database, possibly also other publications chosen by authors.
2015
- Ionescu, CM; Sehnal, D; Falginella, FL; Pant, P; Pravda, L; Bouchal, T; Varekova, RS; Geidl, S; Koca, J, 2015: AtomicChargeCalculator: interactive web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug-like molecules. JOURNAL OF CHEMINFORMATICS 7, doi: 10.1186/s13321-015-0099-x
2012
- Ionescu, CM; Varekova, RS; Prehn, JHM; Huber, HJ; Koca, J, 2012: Charge Profile Analysis Reveals That Activation of Pro-apoptotic Regulators Bax and Bak Relies on Charge Transfer Mediated Allosteric Regulation. PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY 8(6), doi: 10.1371/journal.pcbi.1002565
- Sehnal, D; Varekova, RS; Huber, HJ; Geidl, S; Ionescu, CM; Wimmerova, M; Koca, J, 2012: SiteBinder: An Improved Approach for Comparing Multiple Protein Structural Motifs. JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING 52(2), p. 343 - 359, doi: 10.1021/ci200444d
2011
- Varekova, RS; Geidl, S; Ionescu, CM; Skrehota, O; Kudera, M; Sehnal, D; Bouchal, T; Abagyan, R; Huber, HJ; Koca, J, 2011: Predicting pK(a) Values of Substituted Phenols from Atomic Charges: Comparison of Different Quantum Mechanical Methods and Charge Distribution Schemes. JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING 51(8), p. 1795 - 1806, doi: 10.1021/ci200133w
- Zaměstnáním čerstvých absolventů doktorského studia k vědecké excelenci (CZ.1.07/2.3.00/30.0009), Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, 2012 - 2015
- SYLICA - Synergies of Life and Material Sciences to Create a New Future (286154), Evropská unie, 2011 - 2015
- InterBioNet - Podpora mezinárodní a mezisektorové spolupráce ve výzkumu a vývoji v oblasti věd o živé přírodě (CZ.1.07/2.4.00/17.0042), Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, 2011 - 2014
- Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanických studií k chemoterapii rakoviny (GD301/09/H004), Grantová agentura ČR, 2009 - 2012
- REAKTIVACE - Výzkum reaktivace acetylcholinesterasy metodami výpočetní chemie (OVMASUN200901), Ministerstvo obrany ČR, 2009 - 2012