Tomáš Raček

Publications that are part of the Web of Science database, possibly also other publications chosen by authors.

2021

• Schindler, O; Racek, T; Marsavelski, A; Koca, J; Berka, K; Svobodova, R, 2021: Optimized SQE atomic charges for peptides accessible via a web application. JOURNAL OF CHEMINFORMATICS 13(1), doi: 10.1186/s13321-021-00528-w

2020

• Racek, T; Schindler, O; Tousek, D; Horsky, V; Berka, K; Koca, J; Svobodova, R, 2020: Atomic Charge Calculator II: web-based tool for the calculation of partial atomic charges. NUCLEIC ACIDS RESEARCH 48(W1), p. W591 - W596, doi: 10.1093/nar/gkaa367
• Ison, J; Menager, H; Brancotte, B; Jaaniso, E; Salumets, A; Racek, T; Lamprecht, AL; Palmblad, M; Kalas, M; Chmura, P; Hancock, JM; Schwammle, V; Ienasescu, HI, 2020: Community curation of bioinformatics software and data resources. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS 21(5), p. 1697 - 1705, doi: 10.1093/bib/bbz075

2019

• Ison, J; Ienasescu, H; Chmura, P; Rydza, E; Menager, H; Kalas, M; Schwammle, V; Gruning, B; Beard, N; Lopez, R; Duvaud, S; Stockinger, H; Persson, B; Varekova, RS; Racek, T; Vondrasek, J; Peterson, H; Salumets, A; Jonassen, I; Hooft, R; Nyronen, T; Valencia, A; Capella, S; Gelpi, J; Zambelli, F; Savakis, B; Leskosek, B; Rapacki, K; Blanchet, C; Jimenez, R; Oliveira, A; Vriend, G; Collin, O; van Helden, J; Longreen, P; Brunak, S, 2019: The bio.tools registry of software tools and data resources for the life sciences. GENOME BIOLOGY 20(1), doi: 10.1186/s13059-019-1772-6

2016

• Racek, T; Pazurikova, J; Varekova, RS; Geidl, S; Krenek, A; Falginella, FL; Horsky, V; Hejret, V; Koca, J, 2016: NEEMP: software for validation, accurate calculation and fast parameterization of EEM charges. JOURNAL OF CHEMINFORMATICS 8, doi: 10.1186/s13321-016-0171-1

2015

• GEIDL, S; BOUCHAL, T; RAČEK, T; SVOBODOVA VAREKOVA, R; HEJRET, V; KŘENEK, A; ABAGYAN, R; KOČA, J, 2015: High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications. JOURNAL OF CHEMINFORMATICS 7, doi: 10.1186/s13321-015-0107-1

• Czech National Infrastructure for Biological Data (LM2015047), Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, 2016 - 2019
• SYLICA - Synergies of Life and Material Sciences to Create a New Future (286154), Evropská unie, 2011 - 2015
• InterBioNet - Podpora mezinárodní a mezisektorové spolupráce ve výzkumu a vývoji v oblasti věd o živé přírodě (CZ.1.07/2.4.00/17.0042), Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, 2011 - 2014
• Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanických studií k chemoterapii rakoviny (GD301/09/H004), Grantová agentura ČR, 2009 - 2012
• REAKTIVACE - Výzkum reaktivace acetylcholinesterasy metodami výpočetní chemie (OVMASUN200901), Ministerstvo obrany ČR, 2009 - 2012